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从三个层次分析最大公共子序列

时间:2013-03-31 21:57 来源:互联网 作者:源码搜藏 收藏

对于含有n个字符一个句子,每个位置有两种可能(出现 or 不出现),因此总共有2*2*2....总共2^n-1个(排除空序列)序列。这样找出来知道,在和另一个句子中的子序列意义比较(为了少算点可以只比角长度相同的)。

本文从三个层次分析最大公共子序列

  1. 最大公共子序列长度
  2. 最大公共子序列
  3. 算法分析

 

首先来个区别:单词"cnblogs"

  • 子序列:从单词中抽取字符,不能保证连续抽取。如”cn"、“cns"、”bgs"
  • 连续子序列:从单词中连续抽取字符。如“bolog"、”cnbl"

最长公共子序列(LCS:Longest Common Subsequence)顾名思义,就是几个词语中最长的相同子序列。比如“cnblogs"和”belong"最大公共子序列是“blog"

        从三个层次分析最大公共子序列

最长公共子序列是个非常有用的算法,可以判断两段文字间的”雷同程度“,从而可以判别抄袭。下面先介绍几种找出最长公共子序列长度的算法:

最大公共子序列长度

1.暴力算法

对于含有n个字符一个句子,每个位置有两种可能(出现 or 不出现),因此总共有2*2*2....总共2^n-1个(排除空序列)序列。这样找出来知道,在和另一个句子中的子序列意义比较(为了少算点可以只比角长度相同的)。

显然,这种方法也太暴力了,指数增长,一点技术含量没有。直接舍去了。

2.递归算法

把一个大问题看成几个已经解决了的子问题的综合。
        从三个层次分析最大公共子序列

两个字符串,分别是stra和strb。如果对应长度是lena和lenb。那么就是求解LCS(lena, lenb)。此时先比较stra[lena-1]和strb[lenb-1](字符串是从0开始计数的)。

  • 如果相同则等于LCS(lena-1,lenb-1)+1,此时LCS(lena-1,lenb-1)不知道,接着递归
  • 如果不同则比较LCS(lena-2,lenb-1)和LCS(lena-1,lenb-2),前者大,就等于前者;后者大,后者。中间步骤不知道,接着递归
  • 如果递归到了LCS()中的一个数为-1了那就相当于存在空串了,公共的长度肯定是0了。

参考程序:

从三个层次分析最大公共子序列
#include <stdio.h> #include <string.h> int LCS(int m, int n); char a[100]; char b[100]; int main()
{
    strcpy(a, "cnblogs");
    strcpy(b, "belong"); int lena = strlen(a); int lenb = strlen(b);
    printf("LCS:%d\n", LCS(lena-1, lenb-1)); return 0;
} int LCS(int m, int n)
{ if(m==-1 || n==-1) return 0; else if(a[m] == b[n]) return 1 + LCS(m-1, n-1); else return LCS(m-1, n) > LCS(m, n-1) ? LCS(m-1, n):LCS(m, n-1);
}
从三个层次分析最大公共子序列

3.动态规划

和递归算法的大化小问题思路不同,动态规划是把一个问题转化成一些列的单阶段问题。

在利用动态规划找出最长公共子序列时,目标是求LCR(lena,lenb),我们把任意两点的LCR求出来,此时要用二位数组表示。

基本原理公式还是那样:

从三个层次分析最大公共子序列

此时注意,字符串计数是从0开始的,现在用二维数组表示,就不能像上面一样出现-1了,现在用二维数组表示个数时,从1开始,即LCR[m][n],表示stra[m-1]和strb[n-1]之间的最大子序列长度。

现在用具体的例子阐明动态规划的过程:

stra = "cnblogs"

strb = "belong"

  • LCR[m][0]=0(表示:str[m-1] 和”空“间的关系);同理LCR[0][n]=0
  • LCR[1][1]:先看stra[0]和strb[0]间想不相同('c'和‘b'不相同),就比较LCR[1][0] 和LCR[1][0]都为0,那么LCR[1][1]为0;
  • 一直这样做下去......

         从三个层次分析最大公共子序列

参考程序:

从三个层次分析最大公共子序列
#include <stdio.h> #include <string.h> char stra[100], strb[100]; int lena, lenb; int matrix[100][100]; void LCS(); int main()
{
    strcpy(stra, "cnblogs");
    strcpy(strb, "belong");
    lena = strlen(stra);
    lenb = strlen(strb);
    memset(matrix, 0, sizeof(matrix));
    LCS(); return 0;
} void LCS()
{ int i=0, j=0; for(i=0; i<lena; i++)
    { for(j=0; j<lenb; j++)
        { if(stra[i] == strb[j])
            {
                matrix[i+1][j+1] = matrix[i][j] + 1;
            } else { if(matrix[i+1][j] >= matrix[i][j+1])
                {
                    matrix[i+1][j+1] = matrix[i+1][j];
                } else {
                    matrix[i+1][j+1] = matrix[i][j+1];
                }
            }
        }
    }

    printf("LCS:%d\n", matrix[lena][lenb]);
}
从三个层次分析最大公共子序列

最大公共子序列

有了最长公共子序列长度核心公式,求个长度还是很容易的,现在要求出具体的最大公共子序列。暴力算法是理论上是可以求出来的,但是过于繁琐与低效,弃了。动态规划与递归思路是一样的。

动态规划

这样标记:

  • 当stra[i] == strb[j]时,标斜向上的箭头(记值为0)
  • 当LCR[i+1][j]≥LCR[i][j+1]时,标向左箭头(记值为1)
  • 当LCR[i+1][j]<LCR[i][j+1]时,标向上箭头(记值为-1)

寻找子序列:

  • 见0记下, i--, j--
  • 见1左拐,j--
  • 见-1上拐,i--

图示说明:

      从三个层次分析最大公共子序列

参考算法:

从三个层次分析最大公共子序列
#include <stdio.h> #include <string.h> char stra[100], strb[100]; int lena, lenb; int matrix[100][100]; int tag[100][100]; void LCS(); void getLCS(); int main()
{
    strcpy(stra, "cnblogs");
    strcpy(strb, "belong");
    lena = strlen(stra);
    lenb = strlen(strb);
    memset(matrix, 0, sizeof(matrix));
    LCS();
    getLCS(); return 0;
} void LCS()
{ int i=0, j=0; for(i=0; i<lena; i++)
    { for(j=0; j<lenb; j++)
        { if(stra[i] == strb[j])
            {
                matrix[i+1][j+1] = matrix[i][j] + 1;
                tag[i+1][j+1] = 0;
            } else { if(matrix[i+1][j] >= matrix[i][j+1])
                {
                    matrix[i+1][j+1] = matrix[i+1][j];
                    tag[i+1][j+1] = 1;
                } else {
                    matrix[i+1][j+1] = matrix[i][j+1];
                    tag[i+1][j+1] = -1;
                }
            }
        }
    } //输出次数矩阵 for (i=1; i<=lena; i++)
    { for (j=1; j<=lenb; j++)
            printf("%d ", matrix[i][j]);
        printf("\n");
    }
    printf("****************\n"); //输出方向转移矩阵 for (i=1; i<=lena; i++)
    { for (j=1; j<=lenb; j++)
            printf("%d ", tag[i][j]);
        printf("\n");
    }
    printf("LCS:%d\n", matrix[lena][lenb]);
} void getLCS()
{ int i = lena, j = lenb, sum=0; char seq[100]; while(i != 0 && j != 0)
    { if(tag[i][j] == 0)
        {
            seq[sum] = stra[i-1];
            i--;
            j--;
            sum++;
        } else if(tag[i][j] == 1)
            j--; else i--;
    } for(i=sum-1; i>=0; i--)
        printf("%c ", seq[i]);
}
从三个层次分析最大公共子序列

递归算法

递归算法输出矩阵的思路与动态规划思路完全一致,就是在递归过程中标记,再回溯即可。

参考代码:

从三个层次分析最大公共子序列
#include <stdio.h> #include <string.h> int LCS(int m, int n); void getLCS(); char stra[100], strb[100]; int lena, lenb; int tag[100][100]; char seq[100]; int main()
{ int i, j;
    memset(tag, 0, sizeof(tag));
    strcpy(stra, "cnblogs");
    strcpy(strb, "belong");
    lena = strlen(stra);
    lenb = strlen(strb);
    printf("LCS:%d\n", LCS(lena-1, lenb-1));
    getLCS(); for(i=0; i<=lena; i++)
    { for(j=0; j<=lenb; j++)
            printf("%d ", tag[i][j]);
        printf("\n");
    } return 0;
} int LCS(int m, int n)
{ if(m==-1 || n==-1)
    { return 0;
    } else if(stra[m] == strb[n])
    {
        tag[m+1][n+1] = 1; return 1 + LCS(m-1, n-1);
    } else { if(LCS(m, n-1) > LCS(m-1, n))
        {
            tag[m+1][n+1] = 2; return LCS(m, n-1);
        } else {
            tag[m+1][n+1] = 3; return LCS(m-1, n);
        }
    }
} void getLCS()
{ int i = lena, j = lenb, sum=0; while(i != 0 && j != 0)
    { if(tag[i][j] == 1)
        {
            seq[sum] = stra[i-1];
            i--;
            j--;
            sum++;
        } else if(tag[i][j] == 2)
            j--; else i--;
    }
    printf("The lCS is:"); for(i=sum-1; i>=0; i--)
        printf("%c ", seq[i]);
    printf("\n");
}
从三个层次分析最大公共子序列

算法分析

m表示第一个字串长度,n表示第二个字串长度。

动态规划

时间复杂度:

  • 建立矩阵需要,需要花费时间o(mn)
  • 回溯需要至多花费时间o(m+n)

综上,两者相加,时间复杂度为o(mn)

空间复杂度:

  • 构建矩阵需要空间o(mn)
  • 构建标记矩阵需要空间o(mn)

综上,二者相加,空间复杂度为o(mn)

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